El Cuartel General de la Armada, situado en Madrid, es el conjunto de órganos que encuadran los medios humanos y materiales necesarios para asistir al Jefe de Estado Mayor en el ejercicio del mando de la Armada.

Está constituido por los siguientes órganos:

1. Estado Mayor de la Armada.
2. Jefatura de Sistemas de Información y Telecomunicaciones.
3. Jefatura de Asistencia y Servicios Generales.
4. Órgano de Historia y Cultura Naval.
5. Gabinete del Jefe de Estado Mayor de la Armada.
6. Asesoría Jurídica del Cuartel General de la Armada.
7. Comandancia General de la Infantería de Marina.
8. Sección de Seguridad Naval Central.

Existe además una Intervención Delegada en el Cuartel General de la Armada que, con dependencia orgánica de la Intervención General de la Defensa, ejerce las funciones de control interno, Notaría Militar y asesoramiento económico-fiscal en el ámbito de la Armada.

Organigrama del Cuartel General de la Armada