El Centro Integrado de Gestión y Administración de Rota (CIGAROT), cuyo cometido es la explotación y sostenimiento de los Sistemas de Información y Comunicaciones de todos los buques y unidades ubicados en la Base Naval de Rota. Asimismo presta auxilio a todos los buques que se encuentren atracados eventualmente en la Base Naval de Rota, aunque no dependan orgánicamente del ALFLOT y mantiene una dependencia funcional del AJECIS.

Está integrado por los siguientes centros y organismos:

• Centro de Comunicaciones (CECOM CIGAROT). Con su núcleo principal en el edificio del Cuartel General de la Flota incluye también las instalaciones del CECOM NORTE, situado en un edifico independiente. Como CECOM PRINCIPAL administra, gestiona y opera los sistemas de Radiodifusión, Buque-Tierra, MRL, BRASS, SACOMAR, Sistemas de Información Militar y Telefonía.
• Centro de Apoyo Informático (CAI ROTA). Ubicado en un edificio independiente y dedicado a la explotación y sostenimiento de la red informática de propósito general.
• Subcuenta Cripto. Responsable de la custodia y distribución del material cripto de los buques y unidades ubicados en  la Base Naval de Rota.
• Registro General de Rota. Responsable del registro, control, compulsa, seguimiento y distribución de la documentación, recibida y remitida a través de correos y valijas, dirigida a los buques y unidades ubicados en la Base Naval de Rota.. 

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Centro Integrado de Gestión y Administración de Rota